主引导区位于整个硬盘的0磁道0柱面1扇区，包括硬盘引导程序和分区表。主引导区如果被病毒、误操作等破坏，可能会导致硬盘或数据无法访问。此时应用U盘启动系统，尝试是否可以访问硬盘。如果能访问，说明可能是系统被破坏。如果不能访问，则可能是硬件故障，这就不是一般软件能修复的了。
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主引导程序位于硬盘的主引导扇区，主要用于检测硬盘分区的正确性，并确定活动分区，负责把引导权移交给活动分区的DOS或其他系统。这段程序损坏将无法从硬盘引导，但从软驱或光驱启动后，可以对硬盘进行读写。
修复这种故障的方法也很简单，使用高版本DOS的Fdisk最为方便，当带参数/mbr运行时，将直接更换硬盘的主引导程序。
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