PE系统提供了三种方法启动自定义脚本：Winpeshl.ini、Startnet.cmd 和 Unattend.xml。原生态WinPE系统的默认界面是“命令提示符”窗口，但可以创建自定义的Winpeshl.ini文件，以便运行自己的外壳应用程序。也可以创建自己的 Startnet.cmd批处理文件来运行特定的命令集、批处理文件或脚本。Unattend.xml是WinPE 2.0的新应答文件格式，它取代了Winbom.ini和Winpeoem.sif。
一、使用Winpeshl.ini添加自定义脚本：
可以使用Winpeshl.ini的文件来启动自定义的外壳应用程序。Winpeshl.exe将在启动期间处理Winpeshl.ini中的设置。使用文本编辑器(如记事本)创建具有以下文件目录结构的Winpeshl.ini文本文件。例如：
[LaunchApp]
AppPath = %SYSTEMDRIVE%myshell.exe
[LaunchApps]
%SYSTEMDRIVE%mydirapplication1.exe， -option1 -option2
application2.exe， -option1 -option2
注：将AppPath项设置为外壳应用程序的路径。此路径可以是绝对路径，也可以使用环境变量(相对路径)，例如%SYSTEMROOT%System32Myshell.exe。AppPath 项不支持命令行选项。将此文件保存到WinPE系统映像的%SYSTEMROOT%System32下。
二、使用Startnet.cmd添加自定义脚本：
使用Startnet.cmd可以在WinPE系统中添加自定义的命令行脚本。默认情况下，WinPE系统包括Startnet.cmd脚本，此脚本位于WinPE系统映像的 %SYSTEMROOT%System32 中。当前，主要用Startnet.cmd来启动Wpeinit.exe。用于安装即插即用 (PnP) 设备、处理 Unattend.xml 设置以及加载网络资源。编辑Startnet.cmd 以包括自定义命令。
注意：对于PnP和网络支持，请确保在自定义Startnet.cmd脚本中包含了对wpeinit的调用。
三、使用Unattend.xml添加自定义脚本：
运行imagex /info d：boot.wim，查看WinPE系统映像的信息。我们要注意这一行：
Image Count： 2
说明此WinPE系统映像文件中其实包含了两个映像。每个映像的详细信息在后面有详细的说明。这里要特别说明的是我们需要编辑的是第二个名称为WDS的映像，因为WDS使用此映像来引导计算机。
使用imagex命令加参数mountrw将 *.wim 加载到pemount目录中：
imagex /mountrw c：winpe2pe2.wim 2 c：pemount
使用peimg命令将第三方驱动添加到WinPE 2.0系统中，如需添加多个设备驱动请重复该步骤。
peimg /inf=c：winpe2netdrvxxx.inf c：pemountwindows
使用imagex命令加参数unmount及commit将修改写入到 *.wim 中。
imagex /unmount c：pemount /commit
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