尽管一穷二白，但熊十力的狂狷却不减少年。1932年，经过十年的思考与积累，熊十力发表了他在学术上的扛鼎之作——《新唯识论》，标志着蜚声中外的“新唯识论”哲学体系的诞生，书的署名非常狂——“黄冈熊十力造”，跟佛经的署名某某菩萨造一样。此书一出，即刻引起了佛学界特别是同门师友们的激烈攻击。其师欧阳阅后痛言：“灭弃圣言，唯子真（熊十力号子真）为尤”，措辞严厉。作为反击，欧阳弟子刘衡如更著《破新唯识论》对熊氏其书进行系统破斥，指责他“于唯识学几乎全无知晓”，并指斥其书乃“杂取中土儒道两家之义，又旁采印度外道之谈，悬揣佛法，臆当亦尔”。熊十力自然不甘沉默，立即应战，并著成《破〈破新唯识论〉》一书，对刘氏之斥逐一破解。熊十力与师门的这场论战，一直都没有平息。1942年，欧阳大师病重，熊十力前去探望时，同门仍不肯让他进门。
与佛学界等人相反的是，蔡元培、马一浮等学术界人士却对熊十力的书推崇备至，评价甚高。但熊十力对学术界人士却并不客气，甚至声称“当今之世，讲晚周诸子，只有我熊某能讲，其余都是混扯。”同为一代著名学者的梁漱溟，因为学问方面的事，与熊十力发生了争论，争完之后，熊十力趁梁漱溟转身之际，跟上去就打了梁三拳，口头还骂他是个“笨蛋”。梁漱溟了解熊十力的个性，没有理会就走开了。类似这样的“逸事”还有很多。小说家废名与熊十力是同乡，两人常在一起谈佛，常因不同意见争得面红耳赤。有一次，两人在一起讨论佛学，一言不合，又大声争吵，辩论到紧张时刻，外人听见里面突然陷入寂静，赶紧跑进去看，原来两人已扭打在一起，并互相卡住对方的脖子。这场斗殴后来被演绎成好几个版本，有说两人在桌子底下扭打在一起的，也有说打架时熊十力正“坐在马桶上”的，还有人说，熊十力打不过废名，被打出门外，“边逃边骂”。但是打归打，第二天，废名又跑到熊家，与熊十力像没事人一样继续讨论问题了。
两拒蒋介石 坚持“孤往精神”
熊十力的学识，后来还引起了蒋介石的赏识。20世纪40年代，已在蒋介石侍从室任职的徐复观受蒋介石的委托，前去看望熊十力，并给他带去了一张一百万元的支票。没想到熊十力大声吼着对徐复观说：“你给我快走！蒋介石是狗子，是王八蛋！我怎么能用他的钱！你快拿着走！”蒋介石不死心，后来又两次赠巨款，资助他筹办研究所，熊十力都辞而不受。他说：“当局如为国家培元气，最好任我自安其素。”
1949年以后，熊十力脾性依旧，坚持不肯改造自己，数次给毛泽东写信，要求建立哲学研究所，允许旧学传播。但熊十力的很多著作，由于仍然批判唯物论之缺失，渐渐开始被当做“反动复古主义”而遭到痛批。“文革”开始后，熊十力不挂领袖像，只设孔子、王阳明、王船山座位，朝夕膜拜。在左倾之风愈刮愈紧的日子里，熊十力愈来愈感到孤独和迷茫，他明显地衰老了，目光不再如以前那般炯炯有神，谈吐不再像以前那般潇洒自如，情绪也不再像以前那么热烈激昂了，常常独自一人端坐桌边，面前放上一叠白纸，手中握支秃笔，神情专注，似有万千心事诉诸笔端，却又无从下笔，良久呆坐。
后来，由于迭遭抄家、批判等变故，熊十力精神有些错乱，不断给中央领导写信，连裤袜之上，都写着对“文革”的抗议。他常常穿着一件褪了色的灰布长衫，扣子全无，腰间胡乱地扎一根麻绳，独自一人到街上去或公园里，跌跌撞撞，双泪长流，口中念念有词“中国文化亡了！”“中国文化亡了！”然而，街市熙攘，人皆自危，没有人来理会他，也没有人对他口中所念有丝毫的惊异。
1968年5月23日，熊十力因患肺炎而心力衰竭，在上海虹口医院病逝，享年84岁。一代旷世奇哲和千千万万的文化人一样，被残酷地淹没在“文化大革命”浊流之中。
对于自己一生的意兴豪放，熊十力曾自辩说，“人谓我孤冷，吾以为人不孤冷到极度，不堪与世谐和”，“凡有志于根本学术者，当有孤往精神”。这两句话，或许也是对熊十力自己一生最好的概括。
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